IN2 je tijekom 2003. godine implementirao sustav upravljanja kvalitetom sukladno zahtjevima norme ISO 9001:2000. Sukladnost sustava zahtjevima norme je dva puta potvrđena recertifikacijom, a na recertifikaciji u veljači 2009. godine potvrđena je sukladnost s najnovijom verzijom norme, ISO 9001:2008. Sustav upravljanja kvalitetom u IN2 koncipiran je na način i s ciljem da omogući fleksibilnost upravljanja bez obzira na doseg i opseg pružanja usluge ili na veličinu i složenost pojedinog projekta. Sustav upravljanja kvalitetom osigurava nadzor rada na pružanju usluga od definiranja same usluge i zahtjeva korisnika do ispunjenja zahtjeva – završetka izvršenja usluge. Nadzor pomaže pri otkrivanju problema u radu i organizaciji, donošenju odluka o rješavanju tih problema te upravljanju svim resursima potrebnim za zadovoljenje zahtjeva korisnika.